Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm16439-201ENSMUST00000100687 564 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm13217-201ENSMUST00000120466 953 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 AC155293.1-201ENSMUST00000219793 1026 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Ndrg4-202ENSMUST00000073139 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm16214-201ENSMUST00000143710 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm5311-201ENSMUST00000203518 709 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 AC151971.6-201ENSMUST00000216193 866 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm8170-201ENSMUST00000218581 945 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Rack1-201ENSMUST00000020640 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm42974-201ENSMUST00000199556 2654 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Zwilch-209ENSMUST00000176299 1831 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Saxo2-205ENSMUST00000207693 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Tex35-206ENSMUST00000187546 856 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm18862-201ENSMUST00000204643 933 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 4933439N14Rik-201ENSMUST00000211062 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 AC174647.1-201ENSMUST00000227419 1271 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm12481-201ENSMUST00000102482 297 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm2237-201ENSMUST00000112595 471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm15866-202ENSMUST00000152116 914 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 A430073D23Rik-201ENSMUST00000196262 665 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm35412-201ENSMUST00000220437 999 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm35298-201ENSMUST00000222719 430 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Serpinb6a-203ENSMUST00000076532 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Csmd1Q923L3 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
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