Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl17-ps1-201ENSMUST00000119156 552 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 1700018G05Rik-201ENSMUST00000211116 386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9531-201ENSMUST00000055820 638 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Slc6a12-209ENSMUST00000171008 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mcemp1-201ENSMUST00000014118 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15341-201ENSMUST00000137315 592 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26957-201ENSMUST00000182645 977 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5190-201ENSMUST00000192434 357 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 AC140381.2-201ENSMUST00000217935 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 4930566F21Rik-201ENSMUST00000201177 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 1700022A22Rik-202ENSMUST00000187130 1458 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11235-201ENSMUST00000117763 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
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Kdm5aQ3UXZ9 4930573C15Rik-201ENSMUST00000197707 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42803-201ENSMUST00000201051 451 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 AC165260.2-201ENSMUST00000225371 395 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Galp-201ENSMUST00000037553 650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Tdpoz4-201ENSMUST00000075953 1113 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Lmnb2-204ENSMUST00000179022 3370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Babam2-204ENSMUST00000114515 1497 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm15626-201ENSMUST00000117478 868 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 1700095J12Rik-201ENSMUST00000124620 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11521-201ENSMUST00000143302 329 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Bud31-203ENSMUST00000160075 928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm22662-201ENSMUST00000175290 256 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 4930444A19Rik-202ENSMUST00000190007 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm9515-201ENSMUST00000200276 647 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp868-201ENSMUST00000074982 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kdm5aQ3UXZ9 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms