Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm44501-201ENSMUST00000167713 1229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm45965-201ENSMUST00000221192 1284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 AC133189.3-201ENSMUST00000226269 878 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm42432-201ENSMUST00000197902 1617 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm436-201ENSMUST00000105747 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Platr16-202ENSMUST00000150529 545 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Ctdp1-203ENSMUST00000161003 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Mir6407-201ENSMUST00000184510 101 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm28430-201ENSMUST00000191031 628 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm7554-201ENSMUST00000202282 574 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm45326-201ENSMUST00000209234 721 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr964-ps1-201ENSMUST00000217577 914 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 AC118230.1-201ENSMUST00000220196 656 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tctex1d2-202ENSMUST00000080316 720 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 4933400C23Rik-201ENSMUST00000188610 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sox12Q04890 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Gm14607-201ENSMUST00000119119 491 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sox12Q04890 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms