Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Fn1-203ENSMUST00000186129 7797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Madd-205ENSMUST00000099723 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Mgll-204ENSMUST00000113585 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Thbs2Q03350 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Thbs2Q03350 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Thbs2Q03350 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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