Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm37671-201ENSMUST00000193198 2096 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Padi3-202ENSMUST00000172098 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 4933407K13Rik-203ENSMUST00000138943 4364 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Ralgps1-205ENSMUST00000131298 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Cyp4a12b-201ENSMUST00000094887 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Dnm3-201ENSMUST00000070330 4601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Xlr3a-201ENSMUST00000074619 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Irx2P81066 C330027C09Rik-201ENSMUST00000048374 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Fubp1-220ENSMUST00000200524 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Fkbp5-206ENSMUST00000177939 3844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Proser3-201ENSMUST00000062708 1905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Smyd1-201ENSMUST00000074301 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Irx2P81066 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Pik3c3-203ENSMUST00000115812 3257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Aqp7-201ENSMUST00000030136 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm25661-201ENSMUST00000157704 296 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Adgrf4-201ENSMUST00000024711 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Meis2-203ENSMUST00000102538 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Meis2-201ENSMUST00000028639 2831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Rnf121-201ENSMUST00000089052 2344 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm43481-201ENSMUST00000201715 3672 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Xab2-201ENSMUST00000019614 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 C86187-202ENSMUST00000209497 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm16059-201ENSMUST00000135583 3778 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ubap2-201ENSMUST00000030143 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Unc45b-205ENSMUST00000164945 3555 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Pms1-201ENSMUST00000027267 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Hal-202ENSMUST00000129421 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 D3Ertd751e-201ENSMUST00000026867 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Zbtb3-201ENSMUST00000172175 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Aldob-201ENSMUST00000029987 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 AC157476.2-201ENSMUST00000217574 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ccpg1-202ENSMUST00000085350 2969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Baiap3-201ENSMUST00000169109 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Prc1-201ENSMUST00000047558 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Zfp385b-201ENSMUST00000090766 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Siglech-201ENSMUST00000060416 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Mro-202ENSMUST00000120033 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Tsr2-202ENSMUST00000112683 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Extl1-201ENSMUST00000030643 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Nek11-201ENSMUST00000038648 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Irx2P81066 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms