Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Unc119-202ENSMUST00000100755 933 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm15625-201ENSMUST00000117617 1093 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm4778-202ENSMUST00000159517 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Scgb2b27-203ENSMUST00000185399 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 AC156790.2-201ENSMUST00000227115 568 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Trh-201ENSMUST00000006046 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm12950-201ENSMUST00000121683 417 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm43547-201ENSMUST00000197729 328 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm42710-201ENSMUST00000200608 985 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 AC138716.2-201ENSMUST00000226670 1016 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 120.8 ms