Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Col20a1-201ENSMUST00000108856 4489 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Spdye4a-201ENSMUST00000085733 1819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
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Sh3bp1P55194 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Serpinb6b-203ENSMUST00000164541 1719 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Exosc10-201ENSMUST00000017408 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ap1g1-206ENSMUST00000179104 1096 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Papln-201ENSMUST00000021646 4260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Angptl2-201ENSMUST00000004208 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
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