Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Pde6aP27664 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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