Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Trem1-201ENSMUST00000048782 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tln2-207ENSMUST00000215784 8330 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Unc13d-202ENSMUST00000106450 4046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 P4ha1-201ENSMUST00000009789 4043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm30373-201ENSMUST00000215774 3500 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mro-202ENSMUST00000120033 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Anks1b-203ENSMUST00000099368 2799 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Boc-201ENSMUST00000114634 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Dzank1-201ENSMUST00000081982 6847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Sh3rf2-201ENSMUST00000072008 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Rimbp2-202ENSMUST00000196085 3732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm26862-201ENSMUST00000181886 2191 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Nlrc5-207ENSMUST00000211816 7578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Cd163-202ENSMUST00000112541 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Dclre1b-201ENSMUST00000029435 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ccdc33-204ENSMUST00000119665 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Sema4d-203ENSMUST00000110040 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Xpnpep3-201ENSMUST00000041609 3236 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Vpreb1P13372 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms