Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Cyb5b-201ENSMUST00000034400 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 C730027H18Rik-201ENSMUST00000218381 2300 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
H2-M1F7CXU4 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms