Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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Gm28048F7BCN0 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm27441-201ENSMUST00000185000 105 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm28048F7BCN0 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Gm28048F7BCN0 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Nfic-201ENSMUST00000020461 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm28048F7BCN0 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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