Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44740-201ENSMUST00000205603 1614 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 S100a3-201ENSMUST00000001047 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gng5-ps-201ENSMUST00000120931 205 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm16217-201ENSMUST00000124182 616 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnb1-ps-201ENSMUST00000155338 1287 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccnb1-207ENSMUST00000174038 1182 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930578M01Rik-201ENSMUST00000180490 907 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6331-201ENSMUST00000217890 450 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT030135.2-201ENSMUST00000225255 893 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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