Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Cacna1f-201ENSMUST00000115725 6028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Sema4g-201ENSMUST00000026225 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Spata33-207ENSMUST00000212760 4074 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Gm3550W4VSN7 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms