Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm24161-201ENSMUST00000104592 130 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Fam220-ps-201ENSMUST00000116535 783 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm6939-201ENSMUST00000122029 864 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l1-206ENSMUST00000140436 1865 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm5501-201ENSMUST00000165917 832 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm36980-201ENSMUST00000195643 622 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 4930512J16Rik-201ENSMUST00000203704 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm38034-201ENSMUST00000193915 2069 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Rep15-201ENSMUST00000036194 1662 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm38048-201ENSMUST00000193778 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 A1cf-204ENSMUST00000224564 1432 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Nptn-202ENSMUST00000114121 863 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm13191-201ENSMUST00000136489 416 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm21963-201ENSMUST00000179519 330 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm19058-201ENSMUST00000192135 598 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm37362-201ENSMUST00000194567 634 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm2474-201ENSMUST00000195162 559 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
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Col5a3Q9JLI2 Prrg2-211ENSMUST00000211337 676 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 AC163646.3-202ENSMUST00000228685 691 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Bpifb1-201ENSMUST00000028987 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
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Col5a3Q9JLI2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm22751-201ENSMUST00000102077 109 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Mir692-3-201ENSMUST00000102079 109 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Mir692-2-201ENSMUST00000102081 109 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Ccdc32-203ENSMUST00000110834 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm2716-201ENSMUST00000212350 643 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Tcl1b4-202ENSMUST00000222867 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Mrps23-201ENSMUST00000024486 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms