Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm44863-201ENSMUST00000207613 1422 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Trp73-205ENSMUST00000133533 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Sgca-205ENSMUST00000166320 1428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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Nop56Q9D6Z1 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm21868-201ENSMUST00000185623 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm20803-202ENSMUST00000190968 1230 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm5169-201ENSMUST00000096469 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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