Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Sorcs1-208ENSMUST00000211687 7080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Mllt10-201ENSMUST00000028076 4917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC9.52□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Aco2-201ENSMUST00000023116 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Qars-201ENSMUST00000006838 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Hoxc12Q8K5B8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Otog-201ENSMUST00000164538 10043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm30340-201ENSMUST00000191898 2198 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm31048-201ENSMUST00000196103 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Rpl7l1-201ENSMUST00000078286 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 P3h1-202ENSMUST00000081606 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Kirrel3-208ENSMUST00000188933 3643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Hoxc12Q8K5B8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms