Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm27316-201ENSMUST00000184884 277 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Cd300c2-201ENSMUST00000092464 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Bpifb1-202ENSMUST00000081816 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ncapd2Q8K2Z4 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h4i-201ENSMUST00000102977 727 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15815-201ENSMUST00000120569 255 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Bola3-203ENSMUST00000122216 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15912-201ENSMUST00000128914 578 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm36982-201ENSMUST00000193796 1128 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 AC159261.1-201ENSMUST00000222493 911 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Klk1b24-201ENSMUST00000073713 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ccl27a-201ENSMUST00000074387 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Klk1b21-201ENSMUST00000085455 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Cyp2a21-ps-201ENSMUST00000206638 1471 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Cdk1-202ENSMUST00000119827 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Rplp0-ps1-201ENSMUST00000122125 933 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 4930533B01Rik-201ENSMUST00000123377 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 1500015A07Rik-202ENSMUST00000184530 423 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Zcwpw2-203ENSMUST00000187803 372 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 4933430L12Rik-201ENSMUST00000206788 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr985-201ENSMUST00000060345 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms