Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Acox2-204ENSMUST00000164598 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Timm10b-203ENSMUST00000106783 3273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm19327-201ENSMUST00000220651 3271 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm44647-201ENSMUST00000207402 428 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Qars-203ENSMUST00000134939 2374 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Ncf2-201ENSMUST00000027754 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm7541-201ENSMUST00000118361 535 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 1700029P11Rik-201ENSMUST00000074608 1024 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SrrdQ8K2M3 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Gm8036-201ENSMUST00000118089 1718 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Epx-201ENSMUST00000049768 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Tbpl1-202ENSMUST00000127698 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SrrdQ8K2M3 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms