Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Sgk3-204ENSMUST00000171265 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Sh3bgrl-201ENSMUST00000033598 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Thbs3-202ENSMUST00000119084 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Zfp775-201ENSMUST00000061720 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 H2-M10.3-201ENSMUST00000073546 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Tmem150c-201ENSMUST00000063192 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Usp27Q8CEG8 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Usp27Q8CEG8 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 146.8 ms