Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2S7

Amigo3, Amphoterin-induced protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo3Q8C2S7 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Bgn-207ENSMUST00000169489 1574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm13781-201ENSMUST00000124153 492 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Pou1f1-205ENSMUST00000184525 1020 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm44159-201ENSMUST00000204065 442 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm39348-201ENSMUST00000216861 640 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm8186-201ENSMUST00000053575 386 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Cenph-201ENSMUST00000075550 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 AC147366.2-201ENSMUST00000226859 2038 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Nsa2-ps2-201ENSMUST00000120785 773 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Oosp2-201ENSMUST00000121793 677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Wdr17-204ENSMUST00000129132 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Gm9513-201ENSMUST00000165591 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Mir6981-201ENSMUST00000184293 115 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Rps27-202ENSMUST00000195998 458 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Gm44649-202ENSMUST00000206896 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Apex1-201ENSMUST00000049411 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Amigo3Q8C2S7 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Amigo3Q8C2S7 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm5046-201ENSMUST00000100608 611 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Rab29-202ENSMUST00000112386 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm12072-201ENSMUST00000118293 715 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm4996-201ENSMUST00000122042 784 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Maats1os-201ENSMUST00000133496 326 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 H2al1e-201ENSMUST00000178979 494 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm28462-201ENSMUST00000185217 374 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm28406-201ENSMUST00000186516 397 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm28348-201ENSMUST00000187833 397 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm29404-201ENSMUST00000187914 397 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm28179-201ENSMUST00000188365 613 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm28079-206ENSMUST00000188554 1170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 H2al1b-201ENSMUST00000189531 495 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm29003-202ENSMUST00000190434 453 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm28313-201ENSMUST00000191411 397 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm35670-201ENSMUST00000192493 397 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm37656-201ENSMUST00000192673 397 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Amigo3Q8C2S7 Gm37561-201ENSMUST00000195221 368 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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