Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Usp54Q8BL06 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm12435-201ENSMUST00000118949 1016 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 AC132384.2-201ENSMUST00000218018 526 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 AC155300.1-201ENSMUST00000219134 480 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Olfr642-201ENSMUST00000052660 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm4778-201ENSMUST00000098878 1098 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Olfr463-203ENSMUST00000217095 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm8482-201ENSMUST00000117972 471 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm13841-201ENSMUST00000118829 483 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm11449-201ENSMUST00000119175 476 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm8210-201ENSMUST00000178557 483 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm15454-201ENSMUST00000179718 483 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm37885-202ENSMUST00000195868 685 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Eif3k-204ENSMUST00000208616 909 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Pebp1-201ENSMUST00000036951 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm6344-201ENSMUST00000075962 483 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 A930003A15Rik-201ENSMUST00000100083 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Snora68-201ENSMUST00000104375 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp54Q8BL06 Gm17107-201ENSMUST00000170983 553 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm17733-201ENSMUST00000181883 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm42208-201ENSMUST00000198215 670 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp54Q8BL06 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms