Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ckap2lQ7TS74 Umad1-201ENSMUST00000159168 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Slc1a2-201ENSMUST00000005220 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Bicd2-202ENSMUST00000110084 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Galnt16-206ENSMUST00000219993 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ckap2lQ7TS74 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms