Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Rsrc2-202ENSMUST00000057795 2270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ssx9Q6XAS3 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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