Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm31718-201ENSMUST00000212406 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Tnfrsf9-203ENSMUST00000105671 1278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm26782-203ENSMUST00000227103 751 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 1700061G19Rik-201ENSMUST00000025048 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm14113-201ENSMUST00000121399 976 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Marcksl1-ps4-201ENSMUST00000132531 291 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm16547-201ENSMUST00000159474 293 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Taar7a-201ENSMUST00000078532 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Uqcrc2-201ENSMUST00000033176 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 A530013C23Rik-202ENSMUST00000141923 3489 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Nppa-201ENSMUST00000103230 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Tspan32os-201ENSMUST00000131740 975 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trak1Q6PD31 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms