Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Krt7-201ENSMUST00000068904 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Rin1-208ENSMUST00000225427 4503 ntAPPRIS P2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Limch1-201ENSMUST00000038188 5903 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Trp53i11Q4QQM4 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms