Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm8094-201ENSMUST00000165136 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm23129-201ENSMUST00000104259 132 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm16080-201ENSMUST00000152128 692 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm20091-201ENSMUST00000179683 189 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm4960-201ENSMUST00000182928 1001 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Tpd52l1-204ENSMUST00000214644 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Tnfrsf14-205ENSMUST00000219534 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm5148-201ENSMUST00000079755 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm26908-201ENSMUST00000181856 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 AC151836.1-201ENSMUST00000228730 1637 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Trav13-2-201ENSMUST00000103658 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cst10-202ENSMUST00000109938 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sf3b2Q3UJB0 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sf3b2Q3UJB0 Ighv5-12-4-201ENSMUST00000195381 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Sf3b2Q3UJB0 Gm44939-201ENSMUST00000206939 814 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Cst10-201ENSMUST00000047008 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm10238-201ENSMUST00000089689 408 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Sf3b2Q3UJB0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms