Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

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Length 882 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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Gtf3c3Q3TMP1 Tmem255a-201ENSMUST00000066498 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Hemgn-201ENSMUST00000071096 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29685-201ENSMUST00000219670 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Amt-201ENSMUST00000035230 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Lrba-206ENSMUST00000195524 3322 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Epb41l4a-201ENSMUST00000025234 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r3c-201ENSMUST00000087321 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gosr2-201ENSMUST00000021329 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gtf3c3Q3TMP1 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gtf3c3Q3TMP1 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Nedd1-201ENSMUST00000020163 3534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gtf3c3Q3TMP1 Btc-201ENSMUST00000121044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gtf3c3Q3TMP1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gtf3c3Q3TMP1 Slc34a2-201ENSMUST00000094787 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Gtf3c3Q3TMP1 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Gtf3c3Q3TMP1 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Anxa11os-201ENSMUST00000184083 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Adam1b-201ENSMUST00000079368 3338 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12709-201ENSMUST00000149348 1912 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Osgep-202ENSMUST00000159292 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 AI854703-202ENSMUST00000154570 3806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Gtf3c3Q3TMP1 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms