Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm14126-201ENSMUST00000122345 395 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 CT025561.1-201ENSMUST00000214972 674 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC140209.1-201ENSMUST00000227875 284 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Polb-201ENSMUST00000033938 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm42919-201ENSMUST00000197753 1284 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Retnla-201ENSMUST00000023329 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Treml4Q3LRV9 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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