Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms