Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Zfp710-203ENSMUST00000166250 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 2410004P03Rik-201ENSMUST00000095823 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Bsnd-201ENSMUST00000054472 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Mtfr1-204ENSMUST00000130645 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Avil-203ENSMUST00000129173 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm4409-201ENSMUST00000130734 1919 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 St7-204ENSMUST00000077080 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
SgcdP82347 Gm37593-201ENSMUST00000191669 3254 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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