Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rps13P62301 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms