Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm5403-201ENSMUST00000117105 2795 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 9430015G10Rik-202ENSMUST00000105576 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm43752-201ENSMUST00000198475 697 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Selenos-204ENSMUST00000206044 911 ntTSL 3 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 AC154595.1-201ENSMUST00000225533 1059 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
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PtpreP49446 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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PtpreP49446 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm28438-201ENSMUST00000188299 345 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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PtpreP49446 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm45085-201ENSMUST00000209100 441 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PtpreP49446 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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