Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm14006-201ENSMUST00000122132 981 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm15636-201ENSMUST00000119205 668 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm22388-201ENSMUST00000158194 248 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm31314-201ENSMUST00000201435 609 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm44420-201ENSMUST00000203669 490 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 4930594O21Rik-201ENSMUST00000129750 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Hoxd10P28359 Gm37688-201ENSMUST00000195195 465 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms