Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm25766-201ENSMUST00000104101 131 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Zcchc4-201ENSMUST00000031077 5743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
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Ggta1P23336 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Ggta1P23336 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
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