Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.07□□□□□ -0.96
P18530 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
P18530 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
P18530 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
P18530 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
P18530 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
P18530 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
P18530 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
P18530 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm15983-201ENSMUST00000140000 4814 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Gm45140-202ENSMUST00000204419 5061 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Prok1-202ENSMUST00000197758 3063 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
P18530 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Ern1-201ENSMUST00000001059 6946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
P18530 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
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