Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irf1P15314 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Slc22a13-201ENSMUST00000084797 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm12269-201ENSMUST00000122273 717 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm3047-201ENSMUST00000164069 822 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm3029-201ENSMUST00000168306 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm20822-202ENSMUST00000188422 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm20828-202ENSMUST00000190516 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 AC122305.2-201ENSMUST00000215148 834 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm34165-201ENSMUST00000222012 1174 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 AC151902.1-201ENSMUST00000227800 375 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Fubp1-202ENSMUST00000166984 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm37082-201ENSMUST00000192629 1927 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cacna1c-202ENSMUST00000078320 8062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm15937-201ENSMUST00000120727 1235 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 A330102I10Rik-201ENSMUST00000130109 501 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm14024-201ENSMUST00000141964 560 ntTSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Gm22730-201ENSMUST00000158085 171 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Irf1P15314 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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