Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 AC156802.2-203ENSMUST00000226032 1906 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Nrros-204ENSMUST00000126869 2540 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Abca9-201ENSMUST00000044850 6384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Fam53c-202ENSMUST00000097622 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Atp1a3-202ENSMUST00000102858 3895 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm21115-201ENSMUST00000187565 2578 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm38169-201ENSMUST00000191822 2539 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm42608-201ENSMUST00000197563 2018 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Gm42741-201ENSMUST00000201340 2278 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3239L7N2D9 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms