Protein–RNA interactions for Protein: J3QP49

Gm20795, Predicted gene, 20795, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20795J3QP49 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Sap18-204ENSMUST00000128764 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Mst1r-201ENSMUST00000035203 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 D630003M21Rik-202ENSMUST00000103121 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Camk2b-210ENSMUST00000109815 3780 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Cdc23-203ENSMUST00000133181 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Zfp658-201ENSMUST00000005597 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Svil-204ENSMUST00000127297 6243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Jarid2-208ENSMUST00000173246 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Aen-203ENSMUST00000107425 4956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Ank3-220ENSMUST00000182439 2586 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Lrrc49-204ENSMUST00000114034 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Gm20795J3QP49 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms