Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Atp8b5A3FIN4 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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Atp8b5A3FIN4 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Itgal-205ENSMUST00000170971 3662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Atp8b5A3FIN4 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
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