Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Phka2-203ENSMUST00000112377 3947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PtprfA2A8L5 Gng12-205ENSMUST00000114226 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
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PtprfA2A8L5 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Tsga10ip-201ENSMUST00000044527 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm13039-201ENSMUST00000118638 794 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm20781-201ENSMUST00000193154 693 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm21736-201ENSMUST00000195399 693 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
PtprfA2A8L5 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms