Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Pml-202ENSMUST00000114136 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm15832-201ENSMUST00000146314 1832 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 AC121574.1-201ENSMUST00000228770 3132 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Olfr1199-201ENSMUST00000099813 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ifi35Q9D8C4 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Dusp16-202ENSMUST00000129433 3993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 Echdc1-201ENSMUST00000020034 3856 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ifi35Q9D8C4 2210010C04Rik-201ENSMUST00000031931 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms