Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 1500004A13Rik-209ENSMUST00000185189 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm44698-201ENSMUST00000207382 384 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Il18-203ENSMUST00000213916 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdm1Q9CQK3 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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