Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

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Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Gm11540-201ENSMUST00000117457 780 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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Znf428Q8C1M2 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Znf428Q8C1M2 Gm10228-201ENSMUST00000089105 532 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Znf428Q8C1M2 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Znf428Q8C1M2 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Znf428Q8C1M2 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Znf428Q8C1M2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Znf428Q8C1M2 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Znf428Q8C1M2 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Znf428Q8C1M2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Znf428Q8C1M2 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Rptoros-201ENSMUST00000127450 1174 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 3010001F23Rik-201ENSMUST00000130625 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Znf428Q8C1M2 2410152P15Rik-201ENSMUST00000137405 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Znf428Q8C1M2 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.9 ms