Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm38357-201ENSMUST00000195382 2464 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Notch2-201ENSMUST00000079812 10500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 5330417C22Rik-202ENSMUST00000106625 5836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm29615-201ENSMUST00000185371 697 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm28224-201ENSMUST00000186078 697 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm29001-201ENSMUST00000186177 697 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm28292-201ENSMUST00000186593 697 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm28101-201ENSMUST00000187608 697 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm29076-201ENSMUST00000187689 697 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm28302-201ENSMUST00000187931 697 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm28646-201ENSMUST00000188220 697 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm28205-201ENSMUST00000189177 697 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm29032-201ENSMUST00000189797 697 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm28695-201ENSMUST00000190300 697 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm37448-201ENSMUST00000192795 697 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Sec22cQ8BXT9 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms