Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

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Length 638 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Ubxn6-201ENSMUST00000019722 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 2810433D01Rik-202ENSMUST00000154798 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Ugt1a10-201ENSMUST00000113142 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Adcy7-202ENSMUST00000168545 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Ubash3bQ8BGG7 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms