Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprdQ64487 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Tpcn2-201ENSMUST00000058022 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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PtprdQ64487 B4galnt2-201ENSMUST00000038343 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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PtprdQ64487 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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PtprdQ64487 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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PtprdQ64487 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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PtprdQ64487 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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PtprdQ64487 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprdQ64487 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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PtprdQ64487 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PtprdQ64487 4930412O13Rik-202ENSMUST00000114919 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PtprdQ64487 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm13707-201ENSMUST00000123663 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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PtprdQ64487 Nme6-214ENSMUST00000200468 865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gm6352-201ENSMUST00000203583 1134 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 CT009713.2-201ENSMUST00000225532 1149 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
PtprdQ64487 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms