Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm26976-201ENSMUST00000182929 908 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm20758-201ENSMUST00000220339 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rundc1Q0VDN7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms