Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm12705-201ENSMUST00000129460 872 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm13290-201ENSMUST00000177806 968 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm9162-201ENSMUST00000182081 991 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Taar7f-201ENSMUST00000071691 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Myl9-201ENSMUST00000088552 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm3283-201ENSMUST00000199319 1350 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Mir1905-201ENSMUST00000122779 82 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 2310034O05Rik-201ENSMUST00000185221 1107 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Aven-202ENSMUST00000099588 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm5641-201ENSMUST00000091130 1488 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Slc4a8-204ENSMUST00000162049 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Col9a2Q07643 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms