Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Olfr222-202ENSMUST00000214351 2474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Carhsp1-201ENSMUST00000008537 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 AC108858.2-201ENSMUST00000228186 1425 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Wars-205ENSMUST00000161410 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Sh3bp1P55194 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Sh3bp1P55194 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Sh3bp1P55194 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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