Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Lrpap1-201ENSMUST00000030986 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm13694-201ENSMUST00000178533 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm13693-201ENSMUST00000178960 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm13698-202ENSMUST00000179192 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm13696-202ENSMUST00000180347 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm13691-201ENSMUST00000099947 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm13697-201ENSMUST00000099948 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm13695-201ENSMUST00000099951 2493 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ptpro-201ENSMUST00000077115 5049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Pld5-203ENSMUST00000111167 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ighv5-7-201ENSMUST00000192302 244 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Fga-202ENSMUST00000166581 2587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Tro-201ENSMUST00000087253 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Kcnip3-203ENSMUST00000103215 2732 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Kcnip3-201ENSMUST00000028850 2728 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 St6galnac4-201ENSMUST00000102818 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Ttll9-201ENSMUST00000099197 1797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Aqp4P55088 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms